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お勧め論文 – 生物学者ための機械学習ガイド

生物学的データは急速に規模の拡大とその性質の複雑化をみており、これに伴って「生物学における機械学習の利用」が一般的となってきた。ここでは、生物学的(研究)プロセスへの機械学習適用の手引きとして活用可能な論文を1報紹介しておきたい。

英University College Londonの研究チームがまとめた「A guide to machine learning for biologists」は、Nature Reviews Molecular Cell Biologyから公開されているレビュー論文だ。機械学習の具体的な手法は実に様々であり、一見すると不可解に思える。本レビュー論文では、ディープニューラルネットワークを含む、近年開発され広く利用されている主要な機械学習技術について、読者に平易に紹介することを目的としている。

論文中では、特定の生物学的データにどの手法がどのように適しているかだけではなく、「機械学習を含む実験」に着手する際のベストプラクティスや、考慮すべきポイントについても論じており、機械学習を研究アプローチとして採用したい生物学者にとって実用度が高い。

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TOKYO analyticaはデータサイエンスと臨床医学に強力なバックグラウンドを有し、健康増進の追求を目的とした技術開発と科学的エビデンス構築を主導するソーシャルベンチャーです。 The Medical AI Timesにおける記事執筆は、循環器内科・心臓血管外科・救命救急科・小児科・泌尿器科などの現役医師およびライフサイエンス研究者らが中心となって行い、下記2名の医師が監修しています。 1. 岡本 将輝 信州大学医学部卒(MD)、東京大学大学院専門職学位課程修了(MPH)、東京大学大学院医学系研究科博士課程修了(PhD)、英University College London(UCL)科学修士課程最優等修了(MSc with distinction)。UCL visiting researcher、日本学術振興会特別研究員、東京大学特任研究員を経て、現在は米ハーバード大学医学部講師、マサチューセッツ総合病院研究員、SBI大学院大学客員教授など。専門はメディカルデータサイエンス。 2. 杉野 智啓 防衛医科大学校卒(MD)。大学病院、米メリーランド州対テロ救助部隊を経て、現在は都内市中病院に勤務。専門は泌尿器科学、がん治療、バイオテロ傷病者の診断・治療、緩和ケアおよび訪問診療。泌尿器科専門医、日本体育協会認定スポーツドクター。
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